Лиофилизация начинается в кабине из нержавеющей стали, расположенной внутри цилиндрического основного корпуса и на полках в камере, после перемещения материалов, помещенных в лоток и плотного закрытия крышки кабины.

Вакуумный насос расположен снаружи кабины. Конденсатор может быть как внутри, так и снаружи. Некоторые лиофилизаторы для погрузки и разгрузки имеют отдельные колпачки на обоих концах. Из них одна сторона открывается в выпускную, а другая сторона в погрузочную секции.

Загрузка лотка осуществляется с помощью машин-носителей. Канальные лотки используются для того, чтобы не смещались бутылки.

Для того, чтобы обеспечить утечку пара пробки данных бутылок оставляют приоткрытыми. В конце процесса, расположенный внутри устройства механизм выключается.