Материалы в процессе лиофилизации замораживаются в устройстве под названием лиофилизатор при температуре между -50 и 600 С.

Создает вакуумную среду, обеспечивающую и сублимацию, а так же и сушку. В данное устройство можно помещать  материалы, замороженные в других охладителях. Вместо того, чтобы исходящий водяной пар выпускался при помощи вакуумного насоса, он преобразуется в лёд путем конденсирования в конденсаторах.

Перед началом следующего цикла, лёд размораживается и выпускается наружу. Цикл замораживания формируется из фаз первичной сушки и вторичной сушки.

При вторичной сушке, удержавшиеся в материале последние молекулы выводятся при помощи выкуума. Время варьируется в завимости от продукта. При низкой скорости замораживания образуются большие, при высокой скорости маленькие ледяные кристаллы. А это влияет на соотношение и скорость сушки.